Исследователи из Китая разработали программную платформу для определения клеточного тропизма возбудителя COVID-19. Свое исследование они опубликовали в журнале Aging and disease в 2021 году.1
Генетика
Много вопросов возникает в связи с возрастной «избирательностью» нового коронавируса. Известно, что возбудителем инфекции служит коронавирус острого респираторного синдрома 2 (SARS-CoV-2), а течение болезни в частности зависит от ряда факторов, влияющих на проникновения вируса в клетки. К примеру, ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2) опосредует проникновение SARS-CoV-2 в клетку, а трансмембранная сериновая протеаза 2 (TMPRSS2) активирует вирус.
Подход, который использовали исследователи при создании фреймворка, разрабатывался для определения вирусоспецифичных типов клеток и нарушений тропизма вируса, связанных с возрастом пациента. Ученые измерили разницу в экспрессии генов ACE2 и TMPRSS2 в различных тканых и отдельных клетках у людей различных возрастов.
Особенно интересно, что удалось выявить ассоциированную с возрастом экспрессию ACE2 и TMPRSS2 в иммуно-воспалительных стромальных (стволовых) клетках, а значит, существует некая взаимосвязь между стромальными клетками, коронавирусной инфекцией и старением. Как именно она работает – еще только предстоит выяснить.
Помимо информации о связи со старением, полученные результаты говорят о том, что секвенирование РНК одиночных клеток (scRNA-seq) может применяться для систематического изучения патогенеза вирусных инфекций. За счет быстрого накопления данных scRNA-seq наряду с лучшим пониманием механизмов проникновения вирусов, этот подход может значительно продвинуть исследования вирусных инфекций.
Увеличение продолжительности жизни мух за счет комбинации отдельных генов, что в последствие может быть перенесено на человека