Как возникла идея Open Genes? Мы видим множество сообщений, как влияние на тот или иной ген продлило жизнь. Ген эластина ELN, Klotho, mTOR, IGF 1, VEGF — всё это знаменитые в продлении жизни гены. Воздействие на них существенно продлило жизнь животных.

Есть такие гены и у человека. Признаться, мы совершенно не рассчитываем, что воздействуя на один из них, мы так сразу продлим жизни. Старение — результат небольших изменений работы множества генов. Собственно, наша база даже не про гены, а про изменение их работы с возрастом.

Гипотеза такая: существует комбинация изменений в работе генома, приводящая к продлению жизни человека. У животных мы такие комбинации нашли.

Тут много есть идей, как именно эту комбинацию обнаружить. Но первый шаг очевиден: давайте посмотрим на всё множество генов, от которых зависит продолжительность жизни.

The aim of creating Open Genes is to structure and combine all available data on the genetics of aging within one resource and provide convenient tools for searching, assorting, and comparing genes according to a variety of features: aging-related alterations, association with longevity, lifespan-extending genetical interventions, evolutionary age of gene, disease associations, related mechanisms of aging, interaction with other genes and functions of gene products. This approach is expected to enhance and maximally automatize the search for potential targets in aging therapy.

Мы собрали информацию о 450 генах, очень хорошо её систематизовали и хотим продолжать делать это дальше. Хотим задатасетить всю генетику старения. База у нас очень открытая, всю информацию можно скачать.

Уже сейчас, пользуясь базой данных Open Genes, можно устроить конкурс прогнозов наилучшей комбинации генов. У нас даже теории и механизмы старения вплетены. Возрастозависимые заболевания тоже.

Так что приходите группировать и сравнивать гены по разным критериям: сначала дискуссия, какая комбинация лучше, потом мы идём проверяем её в эксперименте.

Предвидем несколько повторяющихся нелепых возражений и сразу ответим:

1. Да, гена старения не существует. Есть изменения работы генов с возрастом. Именно они нас интересуют.
2. Гены очевидно определяют продолжительность жизни. Внутри вида примерно одинаковая продолжительность, а между видами — разная. В миллион раз иногда отличается.
3. Да, результаты на животных не переносятся автоматически на человека. Переносятся неавтоматически. Глупо выступать против экспериментов на животных.
4. Ни одна теория в старении не доказала свою правоту. Наше предложение — собирать и перепроверять все факты о старении. Пока теории не предложат работающий способ продления жизни человека.
5. Бывает такое, что учёные ошибаются. Всё надо перепроверять.

Чего нам не хватает в существующих базах данных в области генетики?

• Полной структурированной информации об изменениях работы генов, продлевающих жизнь млекопитающим
• Информации об аллельных вариантах генов, ассоциированных с долголетием у людей
• Полной информации о возрастных среднепопуляционных изменениях экспрессии гена по тканям у человека и животных
• Наиболее полных данных об эволюционной истории гена
• Списка из всех генов и их основных характеристик собранных вместе
• Возможности группировать и сравнивать гены по разным критериям и их сочетаниям

В нашей базе биологи вручную собирают информацию об эволюции гена, его функциях, а также методах определения ассоциации гена со старением и продолжительностью жизни. Это уникальные данные, которые вы не найдёте в структурированном виде в других источниках.

Мы также подгружаем часть информации автоматически. И решаем множество биоинформатических задач.